Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx16Q8C080 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx16Q8C080 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx16Q8C080 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx16Q8C080 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx16Q8C080 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx16Q8C080 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx16Q8C080 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx16Q8C080 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx16Q8C080 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx16Q8C080 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx16Q8C080 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx16Q8C080 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx16Q8C080 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx16Q8C080 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx16Q8C080 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx16Q8C080 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx16Q8C080 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx16Q8C080 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx16Q8C080 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx16Q8C080 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx16Q8C080 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx16Q8C080 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx16Q8C080 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx16Q8C080 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx16Q8C080 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx16Q8C080 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx16Q8C080 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx16Q8C080 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.8 ms