Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Triml1Q8BVP1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms