Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms