Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUN5

Smad3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad3Q8BUN5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Smad3Q8BUN5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad3Q8BUN5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms