Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rd3Q8BRE0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rd3Q8BRE0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
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