Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQP8

Rab11fip4, Rab11 family-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip4Q8BQP8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab11fip4Q8BQP8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rab11fip4Q8BQP8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rab11fip4Q8BQP8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip4Q8BQP8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip4Q8BQP8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip4Q8BQP8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip4Q8BQP8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip4Q8BQP8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip4Q8BQP8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip4Q8BQP8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip4Q8BQP8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip4Q8BQP8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip4Q8BQP8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip4Q8BQP8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip4Q8BQP8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip4Q8BQP8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip4Q8BQP8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip4Q8BQP8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip4Q8BQP8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms