Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPS4

Gpr180, Integral membrane protein GPR180, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr180Q8BPS4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gpr180Q8BPS4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpr180Q8BPS4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms