Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY1

Smoc1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smoc1Q8BLY1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smoc1Q8BLY1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smoc1Q8BLY1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smoc1Q8BLY1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smoc1Q8BLY1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smoc1Q8BLY1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smoc1Q8BLY1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smoc1Q8BLY1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smoc1Q8BLY1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smoc1Q8BLY1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smoc1Q8BLY1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smoc1Q8BLY1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smoc1Q8BLY1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smoc1Q8BLY1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smoc1Q8BLY1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smoc1Q8BLY1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smoc1Q8BLY1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smoc1Q8BLY1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smoc1Q8BLY1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smoc1Q8BLY1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smoc1Q8BLY1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smoc1Q8BLY1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smoc1Q8BLY1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smoc1Q8BLY1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Smoc1Q8BLY1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smoc1Q8BLY1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms