Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT3

Gcfc2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcfc2Q8BKT3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcfc2Q8BKT3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcfc2Q8BKT3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcfc2Q8BKT3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcfc2Q8BKT3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcfc2Q8BKT3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcfc2Q8BKT3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcfc2Q8BKT3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcfc2Q8BKT3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcfc2Q8BKT3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcfc2Q8BKT3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcfc2Q8BKT3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcfc2Q8BKT3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcfc2Q8BKT3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcfc2Q8BKT3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcfc2Q8BKT3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcfc2Q8BKT3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcfc2Q8BKT3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcfc2Q8BKT3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcfc2Q8BKT3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcfc2Q8BKT3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms