Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Best2Q8BGM5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms