Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2af1l4Q8BGJ9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms