Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGI4

Fam13a, Protein FAM13A, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam13aQ8BGI4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam13aQ8BGI4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam13aQ8BGI4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam13aQ8BGI4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam13aQ8BGI4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam13aQ8BGI4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam13aQ8BGI4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam13aQ8BGI4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam13aQ8BGI4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam13aQ8BGI4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam13aQ8BGI4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam13aQ8BGI4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam13aQ8BGI4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam13aQ8BGI4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam13aQ8BGI4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam13aQ8BGI4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam13aQ8BGI4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam13aQ8BGI4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam13aQ8BGI4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam13aQ8BGI4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam13aQ8BGI4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam13aQ8BGI4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam13aQ8BGI4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam13aQ8BGI4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam13aQ8BGI4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam13aQ8BGI4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam13aQ8BGI4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fam13aQ8BGI4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fam13aQ8BGI4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam13aQ8BGI4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam13aQ8BGI4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam13aQ8BGI4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam13aQ8BGI4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam13aQ8BGI4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam13aQ8BGI4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam13aQ8BGI4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam13aQ8BGI4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam13aQ8BGI4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam13aQ8BGI4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam13aQ8BGI4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam13aQ8BGI4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam13aQ8BGI4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam13aQ8BGI4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam13aQ8BGI4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam13aQ8BGI4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam13aQ8BGI4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam13aQ8BGI4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam13aQ8BGI4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam13aQ8BGI4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam13aQ8BGI4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms