Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms