Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms