Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Atg4cQ811C2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg4cQ811C2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.5 ms