Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc172Q810N9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc172Q810N9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 287.5 ms