Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrsam1Q80ZI6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrsam1Q80ZI6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrsam1Q80ZI6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrsam1Q80ZI6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrsam1Q80ZI6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms