Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Amigo1Q80ZD8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Amigo1Q80ZD8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Amigo1Q80ZD8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Amigo1Q80ZD8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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