Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ell3Q80VR2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ell3Q80VR2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms