Protein–RNA interactions for Protein: Q80VA5

Sh3tc2, SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc2Q80VA5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3tc2Q80VA5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3tc2Q80VA5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3tc2Q80VA5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms