Protein–RNA interactions for Protein: Q80UZ0

Fgd5, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd5Q80UZ0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fgd5Q80UZ0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgd5Q80UZ0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fgd5Q80UZ0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fgd5Q80UZ0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd5Q80UZ0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd5Q80UZ0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd5Q80UZ0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd5Q80UZ0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd5Q80UZ0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd5Q80UZ0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd5Q80UZ0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd5Q80UZ0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd5Q80UZ0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd5Q80UZ0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms