Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab3gap1Q80UJ7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms