Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ube3cQ80U95 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ube3cQ80U95 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube3cQ80U95 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube3cQ80U95 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube3cQ80U95 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube3cQ80U95 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube3cQ80U95 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube3cQ80U95 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube3cQ80U95 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms