Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pja2Q80U04 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms