Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sgo2Q7TSY8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 796.4 ms