Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Actn1Q7TPR4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actn1Q7TPR4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Actn1Q7TPR4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms