Protein–RNA interactions for Protein: Q78IK2

Usmg5, Up-regulated during skeletal muscle growth protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usmg5Q78IK2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usmg5Q78IK2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms