Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms