Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ino80Q6ZPV2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ino80Q6ZPV2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms