Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPT1

Klhl9, Kelch-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl9Q6ZPT1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl9Q6ZPT1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms