Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smpd4Q6ZPR5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smpd4Q6ZPR5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Smpd4Q6ZPR5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smpd4Q6ZPR5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smpd4Q6ZPR5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smpd4Q6ZPR5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smpd4Q6ZPR5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smpd4Q6ZPR5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpd4Q6ZPR5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpd4Q6ZPR5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpd4Q6ZPR5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpd4Q6ZPR5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpd4Q6ZPR5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpd4Q6ZPR5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpd4Q6ZPR5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpd4Q6ZPR5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpd4Q6ZPR5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpd4Q6ZPR5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpd4Q6ZPR5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpd4Q6ZPR5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpd4Q6ZPR5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpd4Q6ZPR5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpd4Q6ZPR5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpd4Q6ZPR5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpd4Q6ZPR5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpd4Q6ZPR5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smpd4Q6ZPR5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smpd4Q6ZPR5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms