Protein–RNA interactions for Protein: Q6XJV4

Cd200r4, Cell surface glycoprotein CD200 receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200r4Q6XJV4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd200r4Q6XJV4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd200r4Q6XJV4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd200r4Q6XJV4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd200r4Q6XJV4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd200r4Q6XJV4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd200r4Q6XJV4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd200r4Q6XJV4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd200r4Q6XJV4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd200r4Q6XJV4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd200r4Q6XJV4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd200r4Q6XJV4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd200r4Q6XJV4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd200r4Q6XJV4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd200r4Q6XJV4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd200r4Q6XJV4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms