Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms