Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Timd4Q6U7R4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Timd4Q6U7R4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms