Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gja6Q6S5G4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms