Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmeff1Q6PFE7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmeff1Q6PFE7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmeff1Q6PFE7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmeff1Q6PFE7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmeff1Q6PFE7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmeff1Q6PFE7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmeff1Q6PFE7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmeff1Q6PFE7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmeff1Q6PFE7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmeff1Q6PFE7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmeff1Q6PFE7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmeff1Q6PFE7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmeff1Q6PFE7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmeff1Q6PFE7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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