Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim37Q6PCX9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim37Q6PCX9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms