Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BcrQ6PAJ1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BcrQ6PAJ1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BcrQ6PAJ1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BcrQ6PAJ1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BcrQ6PAJ1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BcrQ6PAJ1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BcrQ6PAJ1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms