Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slf2Q6P9P0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slf2Q6P9P0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms