Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc148Q6P5U8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc148Q6P5U8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms