Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg2aQ6P4T0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg2aQ6P4T0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms