Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Podnl1Q6P3Y9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms