Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc189Q6NZQ0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms