Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms