Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fbxo41Q6NS60 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fbxo41Q6NS60 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms