Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ParpbpQ6IRT3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ParpbpQ6IRT3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ParpbpQ6IRT3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ParpbpQ6IRT3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ParpbpQ6IRT3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ParpbpQ6IRT3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ParpbpQ6IRT3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ParpbpQ6IRT3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ParpbpQ6IRT3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ParpbpQ6IRT3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ParpbpQ6IRT3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms