Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt87Q6IMF0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt87Q6IMF0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt87Q6IMF0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt87Q6IMF0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt87Q6IMF0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt87Q6IMF0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt87Q6IMF0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt87Q6IMF0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt87Q6IMF0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt87Q6IMF0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt87Q6IMF0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt87Q6IMF0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt87Q6IMF0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt87Q6IMF0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt87Q6IMF0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt87Q6IMF0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt87Q6IMF0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt87Q6IMF0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt87Q6IMF0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt87Q6IMF0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt87Q6IMF0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt87Q6IMF0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt87Q6IMF0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms