Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt39Q6IFX4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms