Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt40Q6IFX3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt40Q6IFX3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
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