Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Pram1Q6BCL1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pram1Q6BCL1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pram1Q6BCL1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms